Le Syndicat National des salarié.es de l’AFPA organise les personnels qui travaillent sur les 115 établissements de l’AFPA sur tout le territoire. Il est constitué de sections locales dans chaque établissement, d’une coordination dans chaque régions et d’un exécutif national. La CGT est la 1ere organisation aux dernières élections professionnelles avec 33% de représentativité.